取得環保證明文件後 應備文件：
1.經濟部核准函或市政府核准函（以上須加附公司設立/變更登記表）
2.負責人身份證(正反面影本印於A4紙張)
3.建築物使用執照或合法房屋證明
4.土地使用分區證明(於當地市公所申請)
5.建物測量成果圖
6.建築物配置平面圖、建築物面積計算表(計算式)
7.建物登記謄本
8.地籍圖謄本（地政事務所申請）
9.土地登記謄本
10.環保局核准文件正本
11.特許文件：(中、西、農)藥製造、含藥化粧品色素製造業、石油煉製藥、電信管制射頻器材製造業、度量衡器製造業、機械設備製造業(槍、砲、彈、刀)、醫療器材製造業、預錄式光碟製造業。 產品製造流程圖及作業場所平面配置圖
12.郵政匯票5,000元（抬頭：台南市政府.高雄市政府）
13.自來水費單
| 一 | 取得廠房 | 自地(租地)建廠 | 1.向各工業區管理處購買土地或租用土地，並於該土地上建廠，待完成建廠及堪驗合格後，由縣(市)政府核發廠房使用執照； 2.檢附廠房使用執照向所在地之地政事務所申請登記廠房取得合法廠房所有權狀後，再引進相關機器設備並於完成試車後開始營運前依下列工廠設立登記步驟申請工廠設立登記 |
| 現有房屋作為工廠使用 | 如房屋建築物使用執照用途非工廠使用，依法先變更該用途後再依下列工廠設立登記步驟申請工廠設立登記 | ||
| 二 | 向環保局申請核發符合環保法規證明文件 | 取得主管機關核准公司或行號設立登記後 | 應備文件： 1.工廠登記申請書 2.環境保護局配合辦理工廠登記核發符合環保法規證明文件申請書 3.基本運作資料表 4.產品製造流程圖 5.環境相關內容確認表 6.其他： (1).環境影響評估報表／說明書定稿本 (2).固定污染源設置／操作許可證影本(含首、次頁) (3).水污染防治措施計畫准予備查函件影本／廢(污)水排放許可證影本 (4).土壤污染檢測資料備查函影本 (5).環境用藥(製造／輸入)許可證 |
| 三 | 申請工廠登記 | 取得環保證明文件後 | 應備文件： 1.經濟部核准函或市政府核准函（以上須加附公司設立/變更登記表） 2.負責人身份證(正反面影本印於A4紙張) 3.建築物使用執照或合法房屋證明 4.土地使用分區證明(於當地市公所申請) 5.建物測量成果圖 6.建築物配置平面圖、建築物面積計算表(計算式) 7.建物登記謄本 8.地籍圖謄本（地政事務所申請） 9.土地登記謄本 10.環保局核准文件正本 11.特許文件：(中、西、農)藥製造、含藥化粧品色素製造業、石油煉製藥、電信管制射頻器材製造業、度量衡器製造業、機械設備製造業(槍、砲、彈、刀)、醫療器材製造業、預錄式光碟製造業。 產品製造流程圖及作業場所平面配置圖【訂有設廠標準者：食品工廠（如：製酒、礦泉水、便當餐盒）、化粧品、醫療器材、藥物製造、動物用藥、農業用藥、環境衛生用藥、爆竹煙火、飼料工廠】 |
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